برنامه‌ی فلش پلیر همواره از لحاظ امنیتی دارای مشکلات بسیاری بوده و از این‌رو سیستم کاربران بسیاری به واسطه‌ی این برنامه هک شده است. در حقیقت این نرم افزار از لحاظ امنیتی، همواره یکی از ضعیف‌ترین نرم افزارهای تمامی پلتفرم‌ها از جمله ویندوز، مک، اندروید و کروم او‌اس بوده است. ادوبی به طور رسمی اعلام کرده است که تاکنون درچند حمله‌ی ریز و درشت از این حفره استفاده شده و نفوذکنندگان می‌توانند با استفاده از آن، باعث کرش کردن سیستم عامل شوند یا حتی کنترل آن را بدست بگیرند.
تاکنون کمپانی‌های بسیاری تلاش کرده‌اند تا این برنامه را حذف کنند که از جمله‌ی آن‌ها می‌توان به فیسبوک اشاره کرد که تمامی تبلیغات مبتنی بر فلش را بلاک کرده و در عوض از تکنولوژی HTML5 استفاده می‌کند.
حال شرکت ادوبی برای برطرف کردن مشکل اخیر این نرم‌افزار، یک پچ امنیتی مهم را برای آن ارائه کرده است که می‌توانید از این لینک آن را دانلود کنید؛ دانلود و نصب این پچ برای تمامی کسانی که هنوز از فلش پلیر استفاده می‌کنند توصیه می‌شود.
